Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms