Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP6Q7Z6E9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms