Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC46A3Q7Z3Q1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC46A3Q7Z3Q1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC46A3Q7Z3Q1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC46A3Q7Z3Q1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms