Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms