Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC29A4Q7RTT9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC29A4Q7RTT9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms