Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8DQ7L1W4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8DQ7L1W4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms