Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q71RC1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q71RC1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q71RC1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q71RC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q71RC1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q71RC1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q71RC1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q71RC1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q71RC1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms