Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM43BQ6ZT52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms