Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC129Q6ZRS4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms