Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms