Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms