Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms