Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCLAT1Q6UWP7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms