Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms