Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE2Q6PIF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms