Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms