Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF18Q5VWM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF18Q5VWM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms