Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOCADQ5VW36 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms