Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RSPH4AQ5TD94 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms