Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAPCD1Q5SSQ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms