Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf10Q5SRN2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms