Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD3Q5JV73 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms