Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AMER1Q5JTC6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AMER1Q5JTC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms