Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LACTB2Q53H82 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LACTB2Q53H82 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms