Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms