Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms