Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms