Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf22Q49AR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf22Q49AR2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms