Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS9Q3SYG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms