Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms