Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HFEQ30201 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HFEQ30201 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HFEQ30201 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HFEQ30201 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HFEQ30201 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms