Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UVSSAQ2YD98 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UVSSAQ2YD98 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms