Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM71Q2Q1W2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms