Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms