Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC96Q2M329 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC96Q2M329 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms