Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCK2Q16822 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCK2Q16822 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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