Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD1Q16676 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms