Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK2Q16620 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK2Q16620 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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