Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKN1Q16512 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms