Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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