Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA2Q15822 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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