Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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