Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRRQ15256 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms