Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAM2Q15035 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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