Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
R3HDM1Q15032 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R3HDM1Q15032 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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