Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERPUD1Q15011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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