Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRP1BQ14684 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRP1BQ14684 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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