Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RAB33AQ14088 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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RAB33AQ14088 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB33AQ14088 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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