Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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COL4A6Q14031 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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COL4A6Q14031 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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COL4A6Q14031 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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COL4A6Q14031 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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COL4A6Q14031 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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