Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP5Q14008 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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